MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 99989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016791	AT	4	8	22	29	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016791	AT	3	6	39	44	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016791	TC	3	6	56	61	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016791	AT	3	6	94	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016791	TTA	2	6	100	105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016791	TTG	2	6	110	115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016791	TG	3	6	122	127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016791	GTT	2	6	143	148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016791	T	6	6	179	184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016791	A	6	6	201	206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016791	TTAT	2	8	253	260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016791	T	6	6	278	283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016791	ATT	2	6	284	289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016791	ATT	2	6	361	366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259381
15	NC_016791	CTG	2	6	459	464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259381
16	NC_016791	TAA	2	6	469	474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259381
17	NC_016791	TAA	2	6	504	509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259381
18	NC_016791	A	6	6	508	513	100 %	0 %	0 %	0 %	376259381
19	NC_016791	AATAT	2	10	540	549	60 %	40 %	0 %	0 %	376259381
20	NC_016791	T	6	6	622	627	0 %	100 %	0 %	0 %	376259381
21	NC_016791	GCA	2	6	686	691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259381
22	NC_016791	GGA	2	6	746	751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259381
23	NC_016791	TTC	2	6	835	840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259381
24	NC_016791	GAT	2	6	878	883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259381
25	NC_016791	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259381
26	NC_016791	AGAA	2	8	961	968	75 %	0 %	25 %	0 %	376259381
27	NC_016791	AGA	3	9	970	978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259381
28	NC_016791	CT	3	6	999	1004	0 %	50 %	0 %	50 %	376259381
29	NC_016791	AAT	2	6	1021	1026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259381
30	NC_016791	AGAC	2	8	1069	1076	50 %	0 %	25 %	25 %	376259381
31	NC_016791	A	7	7	1153	1159	100 %	0 %	0 %	0 %	376259381
32	NC_016791	TGA	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259381
33	NC_016791	AGGT	2	8	1215	1222	25 %	25 %	50 %	0 %	376259381
34	NC_016791	TAA	2	6	1333	1338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259381
35	NC_016791	AAG	2	6	1374	1379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259381
36	NC_016791	A	6	6	1423	1428	100 %	0 %	0 %	0 %	376259381
37	NC_016791	AAG	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259381
38	NC_016791	A	7	7	1740	1746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016791	TTA	2	6	1766	1771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016791	CTA	3	9	1831	1839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016791	TTA	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016791	A	6	6	1871	1876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016791	ACT	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259382
44	NC_016791	TTC	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259382
45	NC_016791	AAG	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259382
46	NC_016791	AAG	2	6	2120	2125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259382
47	NC_016791	TAG	2	6	2170	2175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259382
48	NC_016791	TTG	2	6	2176	2181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259382
49	NC_016791	TGT	2	6	2243	2248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259382
50	NC_016791	TGA	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259382
51	NC_016791	GAA	2	6	2422	2427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259382
52	NC_016791	TTC	2	6	2500	2505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259382
53	NC_016791	TGA	3	9	2513	2521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259382
54	NC_016791	GGT	2	6	2549	2554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259382
55	NC_016791	GCTT	2	8	2620	2627	0 %	50 %	25 %	25 %	376259382
56	NC_016791	GTT	2	6	2649	2654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259382
57	NC_016791	ATGA	2	8	2706	2713	50 %	25 %	25 %	0 %	376259382
58	NC_016791	GAA	2	6	2793	2798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259382
59	NC_016791	T	6	6	2849	2854	0 %	100 %	0 %	0 %	376259382
60	NC_016791	TGA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259382
61	NC_016791	AG	4	8	2882	2889	50 %	0 %	50 %	0 %	376259382
62	NC_016791	TAC	2	6	2906	2911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259382
63	NC_016791	AAT	2	6	2949	2954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259382
64	NC_016791	ACG	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016791	AATA	2	8	3031	3038	75 %	25 %	0 %	0 %	376259383
66	NC_016791	TTA	2	6	3045	3050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259383
67	NC_016791	A	6	6	3163	3168	100 %	0 %	0 %	0 %	376259383
68	NC_016791	AAT	2	6	3214	3219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259383
69	NC_016791	ATTG	2	8	3245	3252	25 %	50 %	25 %	0 %	376259384
70	NC_016791	ATACAA	2	12	3286	3297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	376259384
71	NC_016791	ATT	2	6	3324	3329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259384
72	NC_016791	ATTT	2	8	3372	3379	25 %	75 %	0 %	0 %	376259384
73	NC_016791	CA	3	6	3397	3402	50 %	0 %	0 %	50 %	376259384
74	NC_016791	TAA	2	6	3424	3429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259384
75	NC_016791	ATTGAA	2	12	3495	3506	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	376259384
76	NC_016791	TAT	2	6	3507	3512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259384
77	NC_016791	A	8	8	3520	3527	100 %	0 %	0 %	0 %	376259384
78	NC_016791	AAATAA	2	12	3529	3540	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	376259384
79	NC_016791	A	7	7	3555	3561	100 %	0 %	0 %	0 %	376259384
80	NC_016791	AGA	2	6	3605	3610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259384
81	NC_016791	TTTA	2	8	3611	3618	25 %	75 %	0 %	0 %	376259384
82	NC_016791	AGA	2	6	3642	3647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259384
83	NC_016791	TTG	2	6	3652	3657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259384
84	NC_016791	TCAAA	2	10	3671	3680	60 %	20 %	0 %	20 %	376259384
85	NC_016791	CAA	2	6	3702	3707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259384
86	NC_016791	AAC	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259384
87	NC_016791	CTT	2	6	3738	3743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259384
88	NC_016791	GCA	2	6	3813	3818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259384
89	NC_016791	ATT	2	6	3822	3827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259384
90	NC_016791	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	376259384
91	NC_016791	ATG	2	6	3949	3954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259384
92	NC_016791	A	6	6	3957	3962	100 %	0 %	0 %	0 %	376259384
93	NC_016791	A	6	6	3983	3988	100 %	0 %	0 %	0 %	376259384
94	NC_016791	ATA	2	6	4014	4019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259384
95	NC_016791	GAT	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259384
96	NC_016791	CAG	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259384
97	NC_016791	AAAG	2	8	4157	4164	75 %	0 %	25 %	0 %	376259384
98	NC_016791	GAT	2	6	4194	4199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259384
99	NC_016791	T	6	6	4322	4327	0 %	100 %	0 %	0 %	376259384
100	NC_016791	GGA	2	6	4338	4343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259384
101	NC_016791	AGT	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259384
102	NC_016791	AATA	2	8	4377	4384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016791	TAA	2	6	4388	4393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016791	GGA	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016791	TGT	2	6	4455	4460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259385
106	NC_016791	A	6	6	4470	4475	100 %	0 %	0 %	0 %	376259385
107	NC_016791	TAT	2	6	4485	4490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259385
108	NC_016791	ACT	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259385
109	NC_016791	GAA	3	9	4546	4554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259385
110	NC_016791	TAA	2	6	4562	4567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259385
111	NC_016791	GGA	2	6	4575	4580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259385
112	NC_016791	TAT	2	6	4596	4601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259385
113	NC_016791	A	7	7	4615	4621	100 %	0 %	0 %	0 %	376259385
114	NC_016791	AT	3	6	4627	4632	50 %	50 %	0 %	0 %	376259385
115	NC_016791	ATC	2	6	4644	4649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259385
116	NC_016791	AT	3	6	4674	4679	50 %	50 %	0 %	0 %	376259385
117	NC_016791	ATTG	2	8	4701	4708	25 %	50 %	25 %	0 %	376259385
118	NC_016791	ATGA	2	8	4733	4740	50 %	25 %	25 %	0 %	376259386
119	NC_016791	ATG	2	6	4761	4766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259386
120	NC_016791	TA	3	6	4823	4828	50 %	50 %	0 %	0 %	376259386
121	NC_016791	CAT	2	6	4853	4858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259386
122	NC_016791	TGA	2	6	4888	4893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259386
123	NC_016791	AGT	2	6	5020	5025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259386
124	NC_016791	GTG	2	6	5061	5066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259386
125	NC_016791	TGT	2	6	5107	5112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259386
126	NC_016791	AAGGG	2	10	5149	5158	40 %	0 %	60 %	0 %	376259386
127	NC_016791	GAA	2	6	5225	5230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259386
128	NC_016791	TAC	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259386
129	NC_016791	TGA	2	6	5371	5376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259386
130	NC_016791	A	7	7	5385	5391	100 %	0 %	0 %	0 %	376259386
131	NC_016791	TTG	2	6	5421	5426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259386
132	NC_016791	TAA	2	6	5434	5439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259386
133	NC_016791	ATTT	2	8	5468	5475	25 %	75 %	0 %	0 %	376259386
134	NC_016791	TGCAA	2	10	5509	5518	40 %	20 %	20 %	20 %	376259386
135	NC_016791	TAA	2	6	5557	5562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259386
136	NC_016791	CAA	2	6	5568	5573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259386
137	NC_016791	ATT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259386
138	NC_016791	TAA	2	6	5712	5717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259386
139	NC_016791	ACAA	2	8	5749	5756	75 %	0 %	0 %	25 %	376259386
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279	NC_016791	TA	3	6	11329	11334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_016791	AT	3	6	11343	11348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_016791	TAAT	2	8	11358	11365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_016791	TAAT	2	8	11385	11392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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